Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD5Q99666 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD5Q99666 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD5Q99666 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD5Q99666 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD5Q99666 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD5Q99666 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD5Q99666 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD5Q99666 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD5Q99666 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD5Q99666 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD5Q99666 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD5Q99666 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD5Q99666 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD5Q99666 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD5Q99666 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD5Q99666 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD5Q99666 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD5Q99666 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD5Q99666 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD5Q99666 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD5Q99666 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD5Q99666 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD5Q99666 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD5Q99666 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD5Q99666 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD5Q99666 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD5Q99666 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD5Q99666 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD5Q99666 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD5Q99666 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD5Q99666 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD5Q99666 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD5Q99666 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RGPD5Q99666 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms