Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms