Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP8

GBP5, Guanylate-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP5Q96PP8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP5Q96PP8 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms