Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms