Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC41A2Q96JW4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC41A2Q96JW4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.3 ms