Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
LRRIQ1Q96JM4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRIQ1Q96JM4 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
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