Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK5RAP3Q96JB5 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms