Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms