Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELP4Q96EB1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms