Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC7

TMCO6, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO6Q96DC7 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMCO6Q96DC7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMCO6Q96DC7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMCO6Q96DC7 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMCO6Q96DC7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMCO6Q96DC7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMCO6Q96DC7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMCO6Q96DC7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMCO6Q96DC7 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMCO6Q96DC7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMCO6Q96DC7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMCO6Q96DC7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMCO6Q96DC7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMCO6Q96DC7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMCO6Q96DC7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMCO6Q96DC7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms