Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HDAC11Q96DB2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDAC11Q96DB2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms