Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG2BQ96BY7 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms