Protein–RNA interactions for Protein: Q93074

MED12, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED12Q93074 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED12Q93074 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED12Q93074 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED12Q93074 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED12Q93074 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED12Q93074 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED12Q93074 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED12Q93074 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED12Q93074 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED12Q93074 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED12Q93074 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED12Q93074 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MED12Q93074 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED12Q93074 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED12Q93074 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MED12Q93074 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED12Q93074 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED12Q93074 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED12Q93074 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED12Q93074 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED12Q93074 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED12Q93074 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED12Q93074 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MED12Q93074 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED12Q93074 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED12Q93074 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED12Q93074 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED12Q93074 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED12Q93074 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MED12Q93074 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED12Q93074 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED12Q93074 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED12Q93074 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED12Q93074 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MED12Q93074 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED12Q93074 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MED12Q93074 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED12Q93074 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED12Q93074 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED12Q93074 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED12Q93074 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED12Q93074 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED12Q93074 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MED12Q93074 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED12Q93074 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED12Q93074 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED12Q93074 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED12Q93074 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MED12Q93074 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED12Q93074 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MED12Q93074 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MED12Q93074 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MED12Q93074 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MED12Q93074 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED12Q93074 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED12Q93074 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED12Q93074 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED12Q93074 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED12Q93074 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED12Q93074 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED12Q93074 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED12Q93074 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED12Q93074 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED12Q93074 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED12Q93074 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
MED12Q93074 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
MED12Q93074 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED12Q93074 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED12Q93074 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED12Q93074 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED12Q93074 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED12Q93074 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED12Q93074 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED12Q93074 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MED12Q93074 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED12Q93074 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MED12Q93074 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED12Q93074 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED12Q93074 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED12Q93074 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED12Q93074 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MED12Q93074 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MED12Q93074 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED12Q93074 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED12Q93074 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED12Q93074 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED12Q93074 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED12Q93074 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED12Q93074 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED12Q93074 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED12Q93074 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED12Q93074 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED12Q93074 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED12Q93074 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED12Q93074 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED12Q93074 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED12Q93074 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MED12Q93074 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED12Q93074 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED12Q93074 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms