Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms