Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW18

C17orf50, Uncharacterized protein C17orf50, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf50Q8WW18 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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C17orf50Q8WW18 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf50Q8WW18 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.2 ms