Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCOLN3Q8TDD5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms