Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CSNK2A3Q8NEV1 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CSNK2A3Q8NEV1 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CSNK2A3Q8NEV1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CSNK2A3Q8NEV1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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