Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms