Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HAPLN4Q86UW8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HAPLN4Q86UW8 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms