Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
APTXQ7Z2E3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APTXQ7Z2E3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms