Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BHLHA9Q7RTU4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms