Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms