Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSTM1Q6UX27 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms