Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF7Q6Q0C0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRAF7Q6Q0C0 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms