Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL35Q6PF15 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms