Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED27Q6P2C8 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms