Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETMD1Q6P1Q0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms