Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms