Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms