Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms