Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms