Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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