Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 PNPO-217ENST00000642017 3465 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms