Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms