Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM259Q4ZIN3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms