Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms