Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXD4L6Q3SYB3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L6Q3SYB3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms