Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC57Q2TAC2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms