Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms