Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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