Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP2B3Q16720 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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