Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRF1Q16656 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRF1Q16656 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRF1Q16656 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRF1Q16656 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRF1Q16656 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRF1Q16656 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRF1Q16656 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRF1Q16656 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRF1Q16656 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRF1Q16656 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRF1Q16656 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRF1Q16656 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRF1Q16656 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRF1Q16656 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRF1Q16656 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRF1Q16656 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRF1Q16656 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRF1Q16656 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NRF1Q16656 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
NRF1Q16656 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRF1Q16656 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms