Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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SGCAQ16586 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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SGCAQ16586 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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SGCAQ16586 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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SGCAQ16586 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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SGCAQ16586 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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SGCAQ16586 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCAQ16586 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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