Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR1Q16570 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms