Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 3,267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPEGQ15772 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms