Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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