Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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