Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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