Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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