Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms